Problem mit Tabellen

[hakaze]

Zunächste habe ich mal viel unwichtiges aus deinem (Nicht-ganz-)Minimalbeispiel rausgeworfen. Das sieht arg nach copy-paste-Stückelei aus mehreren Vorlagen; u.a. die doppelt center-Umgebung, tabularx, longtable, unnötige Spaltendefinitionen ...

Folgendes tut es meiner Ansicht nach schon ganz gut:

\documentclass[a4paper, titlepage, openright, 11pt, notitlepage, twoside, fleqn]{scrreprt}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[ngerman]{babel}

\usepackage{booktabs}
\usepackage{dcolumn}
\usepackage{array}

\newcolumntype{v}[1]{>{\centering\hspace{0pt}}p{#1}}

%D{eingabe_zeichen}{ausgabe_zeichen}{dezimal_stellen}
\newcolumntype{d}{D{,}{,}{3.3}} 

\newcommand{\mrc}[2]{\multicolumn{1}{v{#2}}{#1}}

\begin{document}

\begin{table}
	\centering
	\captionabove{Tests der zweifaktoriellen Varianzanalyse (ANOVA).}\label{tab:ANOVA}
	\begin{tabular}{lddddd} 
		\toprule
		Quelle & \multicolumn{1}{c}{Streuung} & \mrc{Frei\-heits\-gra\-de}{2.0cm} & \mrc{Mittlerer quad. Fehler}{2.2cm} & \multicolumn{1}{c}{F} & \multicolumn{1}{c}{Sig.}\\
		\midrule
		Stücke   & 0,005   & 1   & 0,005   & 0,004   & 0,950\\
		Fehler(Stücke)   & 13,808   & 12   & 1,151   &	&\\
		\hline
		Radiokonfigurationen	& 192,149	& 7   & 27,450   &6,186   & 0,000\\
		Fehler(Radiokonfig.)   & 41,038   & 84   & 0,489	&\\
		\hline
		Stücke $\cdot$ Radiokonfig.	& 68,418   & 7   & 9,774   &22,637   & 0,000\\
		Fehler(Stücke $\cdot$ Radiokonfig.)&36,269& 84   & 0,432   &   	&\\
		\bottomrule
	\end{tabular}
\end{table}

\end{document}

Wichtig ist auch den den p-Spalten \centering zu übergeben und nicht \raggedright
Ansonsten schau nochmal in die dcolumn-Anleitung für ein Feintuning der d-Spalten (ich habe jetzt alle auf 3 Nachkommastellen gesetzt).

Alternativ kann ich auch das siunitx-Paket empfehlen. Das bietet ein sehr guten Tabellensatz von Zahlen in unterschiedlichen Formaten.

EDIT: war wohl etwas langsam beim tippen... da sind schon einige Alternativen.