Also protrusion funktioniert, wenn man sie mit den Lowlevel-Befehlen aus luaoftload aktiviert
(z.B. \font\lmr={Latin Modern Romanrotrusion=default} at 12pt \lmr). Das Problem liegt also auf der fontspec-Seite. Soweit ich das sehe (und wenn ich eine Nachricht von Will von Anfang Juni richtig interpretiere), fehlt einfach noch die entsprechende Option. Es sieht aber so aus, als ließe sich die mit RawFeature oder \newfontfeature leicht nachrüsten:
Code:
\documentclass[fontsize=12pt]{scrartcl}
\usepackage{luaotfload}
\usepackage[EU2]{fontenc}
\usepackage{microtype}
\usepackage{lipsum}
\usepackage{fontspec}
\newfontfeature{Microtype}{protrusion=default;expansion=default;}
%\setmainfont[RawFeature={protrusion=default;expansion=default;},Ligatures=TeX]{Linux Libertine O}
\setmainfont[Microtype,Ligatures=TeX]{Linux Libertine O}
\begin{document}
\lipsum
\end{document}
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