Wenn man \\ am Anfang einer neuen Zeile oder eines neuen Absatzes o. ä. verwendet, kann das sehr leicht vorkommen. Deshalb sollte man eben nie \\ verwenden, um vertikalen Abstand zu erzeugen. Es auch andere Gründe, warum das normalerweise keine gute Idee ist. Es gibt verschiedene Möglichkeiten, sie zu ersetzen. Oftmals ist es am besten, wenn man einen echten Absatz macht und dann ggf. \vspace{\baselineskip} oder auch mit Faktor \vspace{2\baselineskip} macht. Auch Befehle wie \bigskip, \medskip, \smallskip sind sehr nützlich. In selteneren Fällen, beispielsweise in Tabellen, kann man auch das optionale Argument von \\ verwenden, also beispielsweise \\[2\normalbaselineskip]. Für Tabellen bietet sich alternativ häufig auch die Möglichkeit von Paket booktabs zum Einfügen vertikaler Abstände an.

Warum genau das Problem bei dir auftritt und was du am besten dagegen tun solltest, kann ich dir ohne vollständiges Minimalbeispiel leider nicht sagen.