Chapterbib und Teildokumente in Unterverzeichnissen

[ph2]

Hallo!

Immernoch habe ich Probleme mit dem Paket chapterbib und meinen Teildokumenten. Sorry, aber ich muss nochmal dringend um Hilfe bitten.

Ich habe ein Dokument mit mehreren Teildokumenten, welche in unterschiedlichen Verzeichnissen liegen. Es sieht folgendermaßen aus:

chaptertest.tex (Hauptdokument)
Ordner: ms1 (Ordner für 1. Teildokument; enthält ms1.tex und fig1.pdf)
Ordner: ms2 (Ordner für 2. Teildokument; enthält ms2.tex und fig1.pdf)

Ich habe in den Ordnern durch den Durchlauf von latex, bibtex, bibtex, latex, latex (wie dies für das Paket chapterbib nötig ist) für ms1 und ms2 jeweils .aux - Files und .bbl - Files.
Allerdings werden meine Referenzen nicht gefunden.

Hier der Inhalt des Hauptdokumnents:

\documentclass[12pt,oneside,american]{scrbook}
    \renewcommand{\rmdefault}{cmr}
    \renewcommand{\familydefault}{\sfdefault}

%% Schrifteinstellungen
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{cmbright}
\usepackage[a4paper]{geometry}
    \geometry{verbose,tmargin=3.5cm,bmargin=3.5cm,lmargin=4cm,rmargin=3cm}
    \setcounter{secnumdepth}{0}
    \setcounter{tocdepth}{3}
    \setlength{\parskip}{\medskipamount}
    \setlength{\parindent}{0pt}
\usepackage{babel}
\usepackage{textcomp}
\usepackage{amstext}
\usepackage{setspace}

%% BILDER
\usepackage{graphicx}  % zur Grafikdarstellung
\usepackage{capt-of}   % zur Beschriftung von Abb. unter den Abbildungen
\usepackage{rotfloat}  % float - Umgebung: zum Einbinden einer Grafik an einer bestimmten Stelle



\usepackage[unicode=true,
 bookmarks=true,bookmarksnumbered=true,bookmarksopen=true,bookmarksopenlevel=2,
 breaklinks=false,pdfborder={0 0 1},backref=false,colorlinks=false]
 {hyperref}
\hypersetup{
 pdfauthor={MMag. rer. nat. Hörtnagl Paul },
 pdfkeywords={PhD Thesis}}

\makeatletter

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% LyX specific LaTeX commands.
\newcommand{\lyxmathsym}[1]{\ifmmode\begingroup\def\b@ld{bold}
  \text{\ifx\math@version\b@ld\bfseries\fi#1}\endgroup\else#1\fi}

%% Because html converters don't know tabularnewline
\providecommand{\tabularnewline}{\\}

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% Textclass specific LaTeX commands.
\newcommand{\lyxaddress}[1]{
\par {\raggedright #1
\vspace{1.4em}
\noindent\par}
}

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% User specified LaTeX commands.

%%KAPITELDARSTELLUNG
\usepackage{xcolor}
        \colorlet{chapter}{black!75}
        \addtokomafont{chapter}{\color{chapter}}

%% KAPITELVORLAGE mit schwarzen Rechteck
\makeatletter
   \renewcommand*{\chapterformat}{%
        \begingroup% damit \unitlength-Änderung lokal bleibt
             \setlength{\unitlength}{1mm}%
             \begin{picture}(20,40)(0,5)
                       \setlength{\fboxsep}{0pt}
                        \put(0,0){\framebox(20,40){}}%
                        \put(0,20){\makebox(20,20){\rule{20\unitlength}{20\unitlength}}}%
                        \put(20,15){\line(1,0){\dimexpr
                        \textwidth-20\unitlength\relax\@gobble}}%
                        \put(0,0){\makebox(20,20)[r]{%
                        \fontsize{28\unitlength}{28\unitlength}\selectfont\thechapter
                        \kern-.05em% Ziffer in der Zeichenzelle nach rechts schieben
                         }}%
                       \put(20,15){\makebox(\dimexpr
                       \textwidth-20\unitlength\relax\@gobble,\ht\strutbox\@gobble)[l]{%
                       \ \normalsize\color{black}\chapapp~\thechapter\autodot
                       }}%
             \end{picture} % <-- Leerzeichen ist hier beabsichtigt!
     \endgroup
 }

%%ZEICHEN- & SCHRIFTEINSTELLUNGEN
\usepackage{latexsym}   %Symboldarstellung
\usepackage{marvosym} %Symbole
\usepackage{textcomp} %Symbole
\usepackage{amsmath} %Mathematische Symbole
\usepackage{pdfpages}
\usepackage[automark]{scrpage2}
    \automark[chapter]{chapter}
    \clearscrheadfoot
    \ohead{\\\headmark}
    \ihead{\includegraphics[scale=0.25]{pics/logo_schwarz.pdf}}%\pagemark}
    \ofoot[\pagemark]{\pagemark}

%% ABSATZFORMAT
\usepackage{microtype}  %schöner Blocksatz


%% TABELLENDARSTELLUNG
\usepackage{array}      %für saubere Tabellendarstellung
\usepackage{tabularx}  %
\usepackage{multirow,makecell} %wichtig für den thread Befehl in der Tabellendarstellung
\usepackage{booktabs} %
\usepackage{rotating}   %Querformat fuer Tabellendarstellungen
\usepackage{caption}    %Textformat fuer Tab & Fig. Bechriftung
        \captionsetup{format=plain,indention=1cm,margin=5pt,font=small,labelfont=bf,labelsep=endash} %
\usepackage{sidecap}   %Tabellen- und Bildbeschriftungen
\usepackage{expdlist}   %Erweiterung der \itemize-Bedingung
\usepackage{warpcol}   %siehe H. Voss: Tabellen mit LaTex S83	
    \newcolumntype{L}[1]{>{\pcolbegin{r}{#1}}l<{\pcolend}}  %%Linke Sp.
    \newcolumntype{R}[1]{>{\pcolbegin{r}{#1}}r<{\pcolend}}  %%Rechte Sp.
    \newcommand{\pcolhd}[1]{\multicolumn{1}{c}{#1}}

\makeatother

%% LITERATURDATENBANK
\usepackage{url}              % zum Einbinden von URLS ins Litverzeichnis!
\usepackage[numbers]{natbib}
    \onehalfspacing
\usepackage{chapterbib}
    \renewcommand{\bibname}{References}  % Bezeichnung der Literaturliste


\begin{document}

\include{ms1/ms1}
\include{ms2/ms2}

\end{document}

Und hier jeweils der Inhalt von ms1

\chapter{Manuscript}

%% Definition des Bibliothekabschnittes
\label{sec:ms1}


\section*{Living at the border}


\section{Introduction}

In marine \cite{Carlson1982,Hardy1982}. Hydrosphere and
vice versa \citep{Conrad1988,Upstill-Goddard2003}.

% Lakes: Figure 1
\begin{figure}[H]

\captionof{figure}{Physicochemical parameters .\label{fig:lakes1}}

 \begin{center}
    \includegraphics[bb=0 0 350 500]{ms1/ms1_fig1.pdf}
 \end{center}

\end{figure}

%% BIBLIOGRAPHY einfuegen
\bibliography{bib_phd}

bzw. ms2

\chapter{Manuscript}

%% Definition des Bibliothekabschnittes
\label{sec:sml}

\section*{Persistence of bacterioneuston in an alpine lake: a quantitative
assessment of major bacterial groups over two ice\,-\,free seasons}


\section{Introduction }

And atmosphere \citep{Conrad1988,Upstill-Goddard2003},
a at this interface \citep{Conrad1988,Conrad1996,Castle2004}.
The SML in both marine and freshwater ecosystems is usually enriched
in different chemical compounds such as dissolved organic carbon,
phosphate, inorganic nitrogen \citep{Maki1993}. Especially in oligotrophic
systems, enrichments in nutrients could be favorable for bacteria
inhabiting the surface microlayer \citep{Sieburth1983}.


%% SML: Figure 1
\begin{figure}[H]

\captionof{figure}{Physicochemical parameters . \label{fig:sml1}}

\begin{center}
    \includegraphics[bb= 0 0 380 550]{ms2/ms2_fig1.pdf}
\end{center}

\end{figure}

%% BIBLIOGRAPHY einfuegen
\bibliography{bib_phd}

\chapter{Manuscript}

%% Definition des Bibliothekabschnittes
\label{sec:ms2}

\section*{Persistence of bacterioneuston in an alpine lake: a quantitative
assessment of major bacterial groups over two ice\,-\,free seasons}


\section{Introduction }

And atmosphere \citep{Conrad1988,Upstill-Goddard2003},
a at this interface \citep{Conrad1988,Conrad1996,Castle2004}.
The SML in both marine and freshwater ecosystems is usually enriched
in different chemical compounds such as dissolved organic carbon,
phosphate, inorganic nitrogen \citep{Maki1993}. Especially in oligotrophic
systems, enrichments in nutrients could be favorable for bacteria
inhabiting the surface microlayer \citep{Sieburth1983}.


%% SML: Figure 1
\begin{figure}[H]

\captionof{figure}{Physicochemical parameters . \label{fig:sml1}}

\begin{center}
    \includegraphics[bb= 0 0 380 550]{ms2/ms2_fig1.pdf}
\end{center}

\end{figure}

%% BIBLIOGRAPHY einfuegen
\bibliography{bib_phd}

Bilder befinden sich im Anhang!


Ich brauch unbedingt (!) ein kapitelweises Inhaltsverzeichnis. Hab schon alles möglich andere probiert (Pakete bibunits, bibtopic, ...) aber immer hat irgendwas nicht geklappt.

Die Datei chaptertest.bbl ist leer, aber ich vermute mal, das ist bedingst duch das Nichtfinden der Referenzen!

Bitte nochmals Um Unterstützung!

[ph2]

Beim Durchforsten diese ausgeziechneten Forums habe ich die Lösung gefunden:

Wichitg:
Das Literaturverziechnis muss habe ich in einen eigenen Ordner names biblio gelegt (gleiche Odnerhirarchie wie ms1,2).

In den einzelnen Teilen (ms1, ms2, ..) muss es heißen:

%% BIBLIOGRAPHY einfuegen
\bibliographystyle{elsart-harv} %% unbedingt den Stil angeben
\bibliography{biblio/bib_phd}

In der Konsole muss im Hauptordner aufgerufen werden:

latex chaptertest.tex
bibtex ms1/ms1
bibtex ms2/ms2
latex chaptertest.tex
latex chaptertest.tex

weitere Informationen:
http://mrunix.de/forums/showthread.php?t=61771