DNA-Sequenz unter Latex

[thorstenk]

Hi,

ich schreibe gerade an meiner Diplomarbeit. Wir haben an unserem Institut ein betimmtes Programm was uns DNA-Sequenzen bearbeitet und Formatiert.
Wie bekomme ich das Layoutmässig genau so und nicht anders in Latex rein?



1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 60
tacggttcatcctttaaacggctaccacttcaccattctccagctaccgg accctcaagt

a M P S R K F A D G E V V R G R W P G S S -

BseYI
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ctttattatgaagtagaaattctgagccacgacagcacctcccagcttta cactgtgaag
61 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 120
gaaataatacttcatctttaagactcggtgctgtcgtggagggtcgaaat gtgacacttc

a L Y Y E V E I L S H D S T S Q L Y T V K -

tataaagatggaacagagcttgaattgaaagagaatgatattaagccttt aacttccttt
121 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 180
atatttctaccttgtctcgaacttaactttctcttactataattcggaaa ttgaaggaaa

a Y K D G T E L E L K E N D I K P L T S F -

BsaHI
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aggcaaaggaaaggtggctcaacttccagttccccttccagacgccgagg gagtcgatca
181 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 240
tccgtttcctttccaccgagttgaaggtcaaggggaaggtctgcggctcc ctcagctagt

a R Q R K G G S T S S S P S R R R G S R S -


sprich wie kann ich Latex sagen dass er die Formatierung so beibehlten soll wie sie ist?

Danke im Voraus

[countbela666]

Moin,

klingt nach einem Fall für die verbatim-Umgebung.

Grüße
Marcel

[voss]

Hi,

ich schreibe gerade an meiner Diplomarbeit. Wir haben an unserem Institut ein betimmtes Programm was uns DNA-Sequenzen bearbeitet und Formatiert.
Wie bekomme ich das Layoutmässig genau so und nicht anders in Latex rein?



1 ---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 60
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a M P S R K F A D G E V V R G R W P G S S -

BseYI
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BsaHI
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a R Q R K G G S T S S S P S R R R G S R S -


sprich wie kann ich Latex sagen dass er die Formatierung so beibehlten soll wie sie ist?



Umgebung alltt aus dem gleichnamigen Paket, dann kannst du auch mit
Farbe arbeiten, wenn du willst. Interessant ist aber auch
http://tug.org/TeXnik/mainFAQ.cgi?file=misc/dna

Herbert

[thorstenk]

Hi,

danke für eure Hilfe. Das alltt-Paket scheint das Richtige für meine Zwecke zu sein. Wisst ihr zufällig ob man da irgendwie den Zeilenabstand ändern kann?

Das Zweite (http://tug.org/TeXnik/mainFAQ.cgi?file=misc/dna) hört sich ja auch ganz gut an, wenn man da noch die Aminoäurensequnz darstellen könnte (ich brauche halt nicht nur die reine Basensequenz sondern der Übersichthalber drunter auch noch die Aminosäuren. )

Thorsten

[205-XS]

Hallo Thorsten,
da ich gerade vor dem gleichen Problem stehe, wollte ich mal fragen, wie Du das gelöst hast.

Gruß Florian