Versuchs mal mit Glossaries. Im Beispiel unten habe ich die Links nicht hingekriegt, aber mit Hilfe der Dokumentation findest Du das sicherlich raus. Möglicherweise muss man anstatt mit "newacronyms" halt mit "newglossaryentry" arbeiten.
In der Doku steht auch, wie Du das Aussehen des Verzeichnisses verändern kannst.
Code:
\documentclass[10pt,oneside,a4paper,titlepage=true, draft=true]{scrreprt} % Papierformat und Dokumenttyp
\usepackage[ngerman]{babel} % Deutsche Sprache (neue Rechtschreibung)
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage{hyperref}
\usepackage[xindy,acronym,]{glossaries} % creates a glossary
\glsenablehyper
\makeglossaries
\newacronym{das}{DAS}{Disease Activity Score}
\newacronym{zb}{z.B.}{zum Beispiel}
\glsunset{zb}
\begin{document}
\printglossary[type=acronym,style=listdotted,title=Abkürzungsverzeichnis,toctitle=Abkürzungsverzeichnis]
\cleardoublepage
\chapter{Test}
\section{Text}
Ein \gls{das} von 100 ist viel. Das könnte \gls{zb} auf eine Krankheit zurückzuführen sein. Ein \gls{das} von 2 ist wenig.
\section{Achtung}
Das Dokument muss folgendermassen kompiliert werden:\\
latex \\
makeglossaries \\
latex \\
\end{document}
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