Damit würde dann aber nicht das $(prefix) expandiert...

Ich habe aber inzwischen eine andere, vörläufige Lösung:

http://www.gnu.org/software/ac-archi...efine_dir.html

"This macro _AC_DEFINEs VARNAME to the expansion of the DIR variable, taking care of fixing up ${prefix} and such."

Leider ist es damit nicht mehr möglich, das Prefix über "make PREFIX=" nachträglich zu ändern, aber damit kann ich erstmal leben. Wenn jemand eine ultimative Lösung dazu kennt, bitte posten

(btw: Ich habe schon einige configure.in's größerer Projekte gelesen, aber bisher nix gefunden)